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实验室信息学架构(03)ELN、方法数字化与 LES

把“实验记录”变为“结构化方法与数据”,是可复现与自动化的前提。本篇聚焦 ELN(电子实验记录)与 LES(方法执行系统)。

1. 从自由记录到结构化方法

  • 自由文本→模板化→参数化→程序化(带校验与计算)
  • 模板要素:目的、适用范围、仪器/耗材、试剂/标准品、步骤与参数、计算与判定、偏差与异常处理
  • 版本化:方法/模板必须版本化,实验按版本实例化

2. 参数与步骤建模

  • 参数类型:数值、枚举、布尔、文件、序列(多次采集)
  • 约束:范围、精度、依赖、必填/条件必填
  • 步骤:准备→校准→采集→计算→复核
  • 计算:内置函数或脚本(受控),输出可追溯

3. LES:让“执行”可控、可证据化

  • 步骤驱动:指令、采集、校验、判定、分支
  • 即时校验:单位/范围/格式/逻辑校验
  • 设备联动:触发仪器方法、读取通道数据、采集日志
  • 证据沉淀:每步产出结构化记录与附件清单、自动生成审计与报告

4. 与 LIMS/SDMS 的配合

  • 入口:LIMS 下达任务/样本清单
  • 执行:LES 绑定方法版本与参数实例
  • 产出:结果与文件(带元数据)推送回 LIMS / SDMS(建立可追踪链接)

5. 质量与合规(方法层)

  • 双人复核/关键步骤双签
  • 关键参数锁定与变更审批
  • 计算脚本受控与验证证据
  • 偏差捕捉与 CAPA 闭环

6. 最小模板示例(片段)

{
  "template": "HPLC-Assay",
  "version": 3,
  "steps": [
    {"name": "校准", "params": [{"name": "标准溶液浓度", "type": "number", "unit": "mg/mL", "range": [0.8, 1.2]}]},
    {"name": "进样", "params": [{"name": "进样体积", "type": "number", "unit": "uL", "range": [5, 20]}]},
    {"name": "计算", "calc": "ASSAY = (峰面积/标准曲线)*100"}
  ]
}

7. 落地建议

  • 从 1-2 个高频方法起步,优先硬约束(范围/单位),逐步引入脚本与仪器联动
  • 用“参数-证据-结果”三元组检查可复现性

—— 系列第 03 篇,下一篇:仪器数据、CDS 与 SDMS、数据湖。